2022-10-03 - scFlea-Chip - scFLEA-ChIP: perfils d'epigenomes a resolució de cèl·lules individuals

scFlea-Chip

2022-10-03

Tecnologia sense precedents, eficient, reproduïble, sensible i assequible per a la creació de perfils epigenètics de cèl·lules individuals. Enfocament assequible i complet que no requereix l'ús de dispositius específics.

Social: Salut i Seguretat

Les tecnologies de seqüenciació de cèl·lules individuals (ChIP) han sorgit com un assoliment tecnològic innovador per abordar qüestions fonamentals de biologia cel·lular, que actualment no es poden abordar amb enfocaments de seqüenciació massiva. La implementació de tecnologies de seqüenciació per resolució de cèl·lules individuals, com ara RNA-Seq i ATAC-Seq, per a les quals ja s'ha informat de la seva rellevància clínica, serveix per exemplificar el potencial revolucionari de les metodologies epigenètiques de baixa aplicació com ara scFLEA-ChIP. Per tant, scFLEA-ChIP té el potencial de convertir-se en una eina de referència per a la identificació de signatures epigenètiques a nivell de cèl·lula individual, cosa que encara no s'ha aconseguit en el camp de la genòmica. El coneixement derivat de la implementació de scFLEA-ChIP ajudarà a elucidar l'heterogeneïtat cel·lular dins de teixits/individus sans i malalts, així com a dissenyar finalment teràpies específiques per dificultar la progressió de la malaltia.

Manca d'eines d'alta resolució per perfilar epigenèticament mostres escasses i/o degradades per obtenir panells de biomarcadors epigenètics per al diagnòstic, el pronòstic i el seguiment de malalties: les tecnologies unicel·lulars han sorgit com un recurs extraordinari per proporcionar informació sobre la composició cel·lular dels teixits i òrgans i com les diferents poblacions cel·lulars contribueixen a la seva funció. Per a la majoria dels enfocaments genòmics, com ara l'estudi del transcriptoma a resolució unicel·lular, actualment hi ha protocols comercials ben establerts disponibles i àmpliament utilitzats. Tanmateix, l'estudi de l'epigenoma a nivell unicel·lular encara és una qüestió oberta. En particular, en el cas de les interaccions proteïna-ADN, no existeixen solucions de seqüenciació per immunoprecipitació de cromatina unicel·lular (scChIP-Seq) que evitin l'actual manca d'enfocaments eficients i reproduïbles per a mostres d'input ultra baix.

150000000

10000000

1500000

Llicències a empreses epigenètiques

Fins ara, no hi ha cap solució comercial disponible al mercat per identificar les interaccions proteïna-ADN a resolució unicel·lular. Malgrat diversos intents de dur a terme perfils epigenètics a nivell unicel·lular mitjançant scChIP-seq o mètodes alternatius, cap d'aquests ha estat adoptat per la comunitat científica a causa de la seva manca de reproductibilitat i escalabilitat.

Laboratoris de recerca (a través d'empreses epigenètiques)

El projecte no busca finançament en aquesta fase, sinó socis per a la validació clínica amb mostres humanes (individus sans i malalts), així com proves beta en diferents escenaris patològics.

1. Col·laboracions amb la indústria; 2. Beta-testers acadèmics; 3 . Titulars de llicència (empreses epigenètiques)

1. Clinical PoC (technology validation in different settings); 2. IP protection (Priority Patent Filing); 3. Licensing

scFLEA-ChIP és una tecnologia altament reproduïble, sensible, assequible i escalable per perfilar les interaccions proteïna-ADN a partir de mostres de baixa entrada o degradades i amb resolució de cèl·lula única.

Dificultat de la protecció de la PI derivada de la naturalesa de la metodologia

2023: Validació de la tecnologia amb mostres clíniques humanes (col·laboracions amb la indústria i el món acadèmic en diferents entorns) / 2024: Protecció de la propietat intel·lectual (Sol·licitud de patent prioritària) / A partir del 2025: Llicència a empreses epigenètiques

PI en procés d'examen per a la sol·licitud prioritària

Recentment, s'ha presentat una patent prioritària europea per protegir la tecnologia FLEA-ChIP. L'objectiu principal ara és validar la tecnologia en entorns clínicament rellevants en col·laboració amb socis de la indústria i acadèmics i ampliar-ne l'aplicació. L'equip científic de FLEAChIP ha establert una col·laboració amb l'empresa Oryzon Genomics en el marc del Projecte en Col·laboració Pública Privada DICTIONIS.

0

0

scFLEA-ChIP es transformarà finalment en un kit comercial, amb una primera aplicació només per a la recerca seguida d'una fase de desenvolupament d'eines de diagnòstic. Això situarà eficaçment el ChIP de cèl·lules individuals entre altres tecnologies de cèl·lules individuals que actualment tenen un impacte en la recerca i la pràctica clínica. Proporcionarà una comprensió sense precedents de les interaccions proteïna-ADN en el desenvolupament i la malaltia.