Citometria

La plataforma de Citometria es va crear l'any 1999 com a servei de suport a la recerca dins de l'Institut de Recerca Germans Trias i Pujol, al campus Can Ruti de Badalona. A més, també proporciona un servei de diagnòstic clínic en Immunologia a l'Hospital Germans Trias i Pujol i imparteix cursos de formació anuals en citometria de flux. La plataforma ofereix serveis de separació cel·lular, anàlisi i adquisició en analitzador de flux citòmetre, consultoria i formació. Des del febrer del 2006, la plataforma de Citometria es troba a la planta baixa de l'edifici Mar de l'IGTP. Consta de 64 m2, distribuïts en un laboratori exclusiu per a l'ús del separador cel·lular i un espai dedicat als analitzadors de citòmetre de flux, així com una zona informàtica per a anàlisis fora de línia.

Blocs de contingut

High-Dimensional Spectral Cytometry

High-Dimensional Spectral Cytometry

Aurora 5-laser (Cytek Biosciences)

Configured with five lasers (355, 405, 488, 561 and 640 nm), three scatter parameters and 64 fluorescence channels, Aurora allows high dimensional data with designed panels (40-colors simultaneously and beyond). Equipped with Automatic Micro-sampling System (AMS) for high throughput acquisition with 96-well plates. Data analysis with SpectroFlo software for unmixing spectral raw data.

Flow Cytometer Analysers

Flow Cytometer Analysers

Flow Cytometer LSRFortessa SORP (BD Biociencias)

Equipped with solid state blue laser (488nm), red laser He-Ne (640 nm), violet laser (405 nm) and green laser (532 nm) this machine allows you to work with 18 fluoresences and 2 scatter parameter (FSC and SSC) analysing area, height and width of pulse for each one. Digital system processing system with software FACSDiva. HTS system for acquiring samples in 96 well plates.

Flow Cytometer FACSCanto II (BD Biociencias)

Solid state blue laser (488 nm), red He-Ne laser (633 nm) and violet laser (405 nm). This machine can work with eight fluorescences and two dispersion parameters (FSC and SSC) analysing area, height and width. Digital system processing system with FACSDiva software. This program permits off-line compensation and the configuration of biexponential scales.

Flow Cytometer FACSLyric (BD Biosciences)

Equipped with Solid state red He-Ne laser (633 nm) and violet laser (405 nm), this machine collects 10 parameters (FSC, SSC and 8 fluorescences¡ channels). It has an automatic loader for tubes and plates. It includes volume computation and uses FACSuite software.

Luminex® 200 (Luminex Corp.)

Luminex® 200 System is a flexible analyzer based on the principles of flow cytometry. Luminex® 200 sets the standard for multiplexing and offers the ability to perform up to 100 different tests in a single reaction volume and use either magnetic beads or plain polystyrene beads. The equipment performs higher sample throughput with a 96-well plate read time of only 45 minutes.

Off-line analysis software

Off-line analysis software

Software

FlowJo, BD FACSDiva and CellQuestPro are installed in Apple iMac Intel i7 16 GB RAM with MAC OSX and Windows (XP y 7) systems. Workstation with Windows10.

Cell Sorters

Cell Sorters

The FACSAria II (BD Biociencias) cell separator

Three lasers (405, 488 y 633 nm), 13 fluorescent detectors (13 fluorescent and 2 light scattering). ACDU (Automated Cell Deposition Unit) for sorting different types of well plates and slides. Options installed: aerosol evacuation system (AMO) and refrigerated bath temperature control. Software FACSDiva. Sorting speed >20.000 cells/sec.

Bigfoot Spectral Sorter

The detection system is equipped with 5 lasers (346nm, 405nm, 488nm, 561nm, and 640nm) and a total of 53 detectors, 5 of which are dedicated to FSC and SSC scatter parameterization. It also has light depolarization filters for SSC scatter parameters on the blue laser.

The Bigfoot software allows working in both conventional and spectral modes and is housed within a class II biosafety cabinet with an aerosol extraction system featuring HEPA filters.

The cell sorting module consists of a jet-in air system and is equipped with 70, 100, 120, and 150 micrometer nozzles. Collection can be performed in 1.5mL eppendorf tubes, 5mL tubes, 15mL and 50mL falcon tubes. It is also possible to collect in various types of plates, allowing simultaneous 4-way sorting in a 96-well plate. Both the acquisition and collection ports are independently temperature controlled (4-37°C).

Contactes institucionals / Cap de plataformes

DAVID IZQUIERDO
DAVID IZQUIERDOCap dels Serveis Científic-Tècnics
IGTP

Dades provisionals

Carolina Gálvez Montón (Responsable) | Correu electrònic:   cgalvez@igtp.cat  | +34 935 543 050

Centres CERCA

Badalona, Spain

1995

IGTP

Propietaris

Llista Centres CERCA

Equipament i Serveis

Separació Cel·lular Separador Cel·lular FACSAria II (BD Biosciences) Tres làsers (405, 488 i 633 nm), quinze detectors (tretze fluorescències i dos paràmetres de dispersió de la llum). ACDU (Unitat Automatitzada de Deposició Cel·lular) per a la separació en diferents tipus de plaques i portaobjectes; opció de cel·la individual. Opcions instal·lades: sistema d'evacuació d'aerosols (AMO) i control de temperatura per al bany refrigerat. Programari FACSDiva. Citòmetres de flux analitzadors LSR Fortessa SORP Citòmetre de flux (BD Biosciences) Equipat amb làser d'estat sòlid blau (488 nm), làser He-Ne vermell (640 nm), làser violeta (405 nm) i làser verd (532 nm), permet treballar amb 18 fluorescències i 2 paràmetres de dispersió (FSC i SSC), analitzant per a cadascun l'àrea, l'alçada i l'amplada del pols elèctric. Processament, adquisició i anàlisi de senyals digitals amb programari FACSDiva. Sistema HTS per a l'adquisició de mostres amb plaques de 96 pous. Separador cel·lular FACSLyric (BD Biosciences) Equipat amb làser blau d'estat sòlid (488 nm), làser vermell He-Ne (633 nm) i làser violeta (405 nm), permet treballar amb deu fluorescències i dos paràmetres de dispersió (FSC i SSC). Sistema de processament de senyal digital amb programari BD FACSSuite. Equipat amb carregador de mostres automatitzat per a tubs i plaques de 96 pous. Citòmetre de flux FACSCanto II (BD Biosciences) Equipat amb làser blau d'estat sòlid (488 nm), làser vermell He-Ne (633 nm) i làser violeta (405 nm), permet treballar amb vuit fluorescències i dos paràmetres de dispersió (FSC i SSC). Sistema de processament de senyal digital amb programari FACSDiva. Equipat amb carregador de mostres automatitzat per a tubs (Loader). Luminex® 200 (Luminex Corp.) El sistema Luminex® 200 és un analitzador basat en els principis de la citometria de flux. El Luminex® 200 estableix l'estàndard per a la multiplexació i ofereix la capacitat de realitzar fins a 100 proves diferents en un sol volum de reacció i utilitzar esferes magnètiques o de poliestirè. Aconsegueix un gran rendiment de mostra amb un temps de lectura de placa de 96 flascons de només 45 minuts. Programes d'anàlisi fora de línia Programari FlowJo, FACSDiva i CellQuestPro instal·lat en un ordinador iMac de 27" Intel i7 16 GB de RAM amb sistemes MAC OSX i Windows (XP i 7). Citometria espectral d'alta dimensional Làser Aurora 5 (Cytek Biosciences) Instal·lat el maig de 2020, està configurat amb cinc làsers (355, 405, 488, 561 i 640 nm), tres paràmetres de dispersió i 64 canals de fluorescència. L'Aurora permet obtenir dades d'alta dimensionalitat amb panells dissenyats (40 colors simultàniament i més). Equipat amb un sistema de micromostreig automàtic (AMS) per a l'adquisició d'alt rendiment amb plaques de 96 pous. Anàlisi de dades amb el programari SpectroFlo per diferenciar dades en brut espectrals.

Separació cel·lular Els citòmetres de flux separadors (FACSaria II) permeten separar les cèl·lules segons paràmetres prèviament definits per l'operador. Per purificar diferents poblacions cel·lulars, la citometria de flux està especialment dissenyada per a aplicacions que requereixen una alta puresa de recollida. L'ús de múltiples fluorocroms simultàniament permet classificar i separar subpoblacions cel·lulars en funció de l'expressió de diferents propietats cel·lulars. La preparació de l'experiment de separació cel·lular requereix una sèrie de passos previs a la seva realització que s'han d'especificar prèviament amb el responsable de la Plataforma de Citometria. Adquisició i anàlisi amb citòmetre analitzador de flux BD FACSCanto II, BD FACSLyric i BD LSR Fortessa són els citòmetres analitzadors que l'usuari pot utilitzar per dur a terme diferents estudis. Aquests equips poden ser utilitzats directament per l'usuari, ja sigui acreditant experiència en el maneig d'aquests equips o mitjançant un curs previ per part del personal de la plataforma de Citometria. A més, el separador cel·lular FACSAria II es pot utilitzar com a citòmetre analitzador, especialment en casos de necessitat d'utilitzar més detectors de fluorescència. Anàlisi fora de línia en entorn Mac/Windows amb programari FACSDiva i FlowJo, compensació fora de línia i escales “Logicle” o toponencials i ModFit. Disseny de formació de cursos a mida. Anualment es fan diversos cursos sobre els fonaments i les aplicacions de la citometria de flux a l'IGTP. Consultoria La plataforma de citometria ofereix als usuaris un servei de consultoria sobre temes relacionats amb la citometria de flux.

Categorització

Dominis RIS3CAT

Dominis RIS3CAT
CERCA GINYS Categories

GINYS-IGTP-002

Procediment d'accés i tarifes

Obre

Xarxes institucionals