Metabolòmica

El centre ofereix consultoria i serveis en camps d'estudi que requereixen tècniques de proteòmica o metabolòmica basades en espectrometria de masses. Configurem l'anàlisi de metabòlits mitjançant perfils diferencials o dirigits (molècules específiques) en qualsevol tipus de fluid o teixit biològic, inclosa l'exhalació respiratòria. Perfeccionarem qualsevol nova prova en aquests dos camps que requereixin els nostres clients. L'activitat del Centre de Proteòmica i Metabolòmica es basa en col·laboracions amb investigadors per refinar la tècnica necessària, analitzar mostres i preparar els resultats. Ens centrem en el camp biomèdic; identificació i validació de biomarcadors, mecanismes de malaltia mitjançant perfils d'expressió de proteïnes, modificacions posttraduccionals i interaccions proteïna-proteïna.

Blocs de contingut

Spectrometers

Spectrometers

Hybrid Mass Spectrometer Q-TOF Micro ESI-QqTOF MS and Nano HPLC (Agilent serie 1200™)

QqT Hybrid spectrometer coupled to a nano liquid chromotagraph for identification of peptides and proteins. It can also carry out metabolite analysis in linear mode. Nominal resolution of 20,000. It is used in tandem mode to identfiy peptides in single mode for quantification for profile analyses.

Software:

- Compass server - HyStar 3.2 - MicrOTOF Control - Data Analysis - Sequence Editor - Metabolite Detect - Library Editor - Quant Analysis - Profile Analysis Integrated with ProteinScape

MS/MS with attachment for ISD experiments (In SourceDecay)

Triple Quadruple Mass Spectrometer ESI- QQQ MS (Agilent™ 6410 BA) and uPLC quaternary (Agilent™ 1260 Infinity)

Spectrometer coupled to uPLC for metabolite quantification in MRM mode (multiple reaction monitoring). Also operates in four other operation modes, SIM (single ion monitoring), ion precursors, ion fragments, neutral losses.

Software

- Mass Hunter Data Adquisition - Mass Hunter QualitativeAnalysis - Mass Hunter QuantitaveAnalysis

Gas Cromatograph coupled to Mass Spectometer

GC/EI+Ci+Ci-/MS (GC series™ con MD800™ y AS2000™ Thermo Instruments).

– Softwares: MassLab con librerías NIST y WiLLEY

Thermal desorption for volatiles (MW-1A™ Rektorik)

Gas chromatograph FID (flame ionization)

- GC/FID (AutoSystem™ Perkin Elmer)

Software

Clarity (6 channels)

MALDI TOF/TOF Autoflex Speed TOF/TOF

Mass spectrometer MALDI with nominal resolution for 20.000 para peptides

Capability for experiments in MS, MS/MS and three MS masses for protein molecular weights - MS/MS with attachment for ISD (In SourceDecay) - MS/MS with attachment LIFT peptide sequencing, glycans - MS/MS/MS with attachment CID + LIFT for high energy fragmentation for sequencing protein terminals e fragmentación a alta energía para

Equipment integrated with the platform: - Compass - Clinprot - ClinPro Tools 2.2 - Bio Tools 3.1 - Nano-MALDI - WARP-LC - MASCOT versión 2.5

Software: FlexControl, Flex Imaging, ProteinScape Imageprep – Attachment for tissue sample preparation for MALDI imaging

Analytical and Preparative Liquid Chromatographs

Analytical and Preparative Liquid Chromatographs

HPLC quatenary pump with UV/vis Detector and Column Heater

(Waters™ 600 series)

Software

ClarityClarity (6 channels)

FPLC Äkta purifier™ (GE Healthcare)

FPLC for protein purification

Software

Unicorn

HPLC alliance™ 2695 (Waters) con detectores 2996 UV/vis y desviación del índice de refracción 2414FPLC

Software

Empower

HPLC alliance™ 2695 (Waters) con detectores 2996 UV/vis y fluorescencia 2475

Software

Empower

Contactes institucionals / Cap de plataformes

DAVID IZQUIERDO
DAVID IZQUIERDOCap dels Serveis Científic-Tècnics
IGTP

Dades provisionals

José María Hernández Pérez -

José María Hernández Pérez -

Carolina Gálvez Montón (Responsable) | Correu electrònic:   cgalvez@igtp.cat  | +34 935 543 050

Centres CERCA

Badalona, Spain

1995

IGTP

Propietaris

Llista Centres CERCA

Equipament i Serveis

Espectròmetres Q-TOF Micro ESI-QqTOF MS i Nano HPLC Espectròmetre de masses híbrid (sèrie Agilent 1200™) Espectròmetre híbrid QqT acoblat a un nanocromatograf líquid per a la identificació de pèptids i proteïnes. També pot realitzar anàlisis de metabòlits en mode lineal. Resolució nominal de 20.000. S'utilitza en mode tàndem per identificar pèptids en mode únic per a la seva quantificació per a l'anàlisi de perfils. Espectròmetre de masses triple ESI-QQQ MS (Agilent™ 6410 BA) i espectròmetre acoblat a UPLC quaternari uPLC (Agilent™ 1260 Infinity) per a la quantificació de metabòlits en mode MRM (monitorització multireacció). També funciona en quatre altres modes de funcionament: SIM (monitorització d'ions individuals), precursors d'ions, fragments d'ions i pèrdues neutres. Cromatògraf de gasos acoblat a l'espectròmetre de masses GC/EI + Ci + Ci–/MS (sèrie GC™ amb MD800™ i AS2000™ Thermo Instruments). Agent desorbent tèrmic per a aus (MW-1A™ Rektorik). Cromatògraf de gasos FID (ionització de flama). MALDI TOF/TOF Autoflex Speed ​​​​TOF/TOF–. Espectròmetre de masses MALDI amb resolució nominal per a 20.000 parapèptids. Cromatògrafs líquids analítics i preparatius. Bomba quaternària HPLC amb detector UV/cargol i escalfador de columna (Waters Series™ 600). FPLC Äkta Purifier™ (GE Healthcare). HPLC alliance™ 2695 (Waters) amb 2996 detectors UV/vis i desviació de l'índex de refracció. 2414FPLC. HPLC alliance™ 2695 (Waters) amb 2996 detectors UV/vis i 2475 detectors de fluorescència.

Serveis de Metabolòmica Perfils de metabòlits de tot tipus (volàtils, semivolàtils i no volàtils, polars i no polars) generalment per al descobriment de biomarcadors Anàlisi GC/MS (Thermo GC8060 MD800 EI+, CI-, CI+) ESI-QqTof MS Perfil LC/MS nanoHPLC mostra (Agilent 1200 BrukerMicrOTOFQ) (Anàlisi de perfil) ESI-QQQ Anàlisi uPLC (Agilent 1260 Agilent 6410BA) Identificació i descripció de metabòlits Anàlisi GC/MS (Thermo GC8060 MD800 EI+) Anàlisi LC/MS/MS mostra nanoHPLC ESI-QqTof MS Quantificació absoluta i relativa de molècules petites Anàlisi GC/MS SIM (Thermo GC8060 MD800 EI+, CI-, CI+) Anàlisi GC FID (Perkin Elmer) ESI-QqTof MS LC / Perfil MS de mostra nanoHPLC (Agilent 1200 BrukerMicrOTOFQ) (Anàlisi de perfil) Anàlisi UPLC ESI-QQQ, MRM (Agilent 1260 Agilent 6410BA) Dins d'aquesta secció, la nostra unitat ha desenvolupat procediments per a: àcids grassos de cadena curta mitjana i gran en sèrum i membranes cel·lulars aminoàcids àcids orgànics a l'orina acilcarnitines plasmàtiques prostanoides plasmàtics compostos volàtils de carboni a l'alè hormones tiroïdals lliures al plasma hormones esteroides a la saliva sucres a l'orina mucopolisacàrids en sèrum i orina

Categorització

Dominis RIS3CAT

Dominis RIS3CAT
CERCA GINYS Categories

GINYS-IGTP-004

Procediment d'accés i tarifes

Obre

Xarxes institucionals