Microscòpia

La Plataforma de Microscòpia es va crear per proporcionar suport científic i tecnològic a grups de recerca i serveis clínics per a experiments basats en microscòpia en totes les etapes, des de la planificació i execució d'experiments, la imatge fins al postprocessament d'imatges. El centre ofereix consultes tant a l'IGTP com a grups externs que ho requereixin. S'organitzen sessions inicials de formació i actualització per a usuaris nous i recurrents, prèvia sol·licitud. Els usuaris formats i autoritzats poden utilitzar les instal·lacions de forma autoservei o amb l'ajuda del personal de les instal·lacions, segons les seves necessitats. Per a qualsevol consulta, poseu-vos en contacte amb el Dr. Jakub Chojnacki.

Blocs de contingut

Abberior Infinity super-resolution microscope

This microscope is housed at the Comparative Medicine and Bioimage Centre of Catalonia (CMCiB) NCB3 facility.

Abberior STEDYCON

Abberior STEDYCON is a compact confocal & super-resolution microscope capable of 4-colour imaging in confocal and STED super resolution modes (resolution down to 40 nm). STEDYCON is coupled to fully motorised Olympus IX83 body equipped with QUAD-band epifluorescence illumination as well as 10x, 20x dry objectives plus 40x and 63x oil objectives. STEDYCON software for obtaining and analysing images also comes with SVI Huygens Pro software for fast image stitching and deconvolution.

Leica DMI6000 B inverted microscope

Fully motorised Leica DMI6000 B inverted widefield microscope for brightfield and fluorescence imaging with fluorescence filter sets for UV, Blue and Orange light excited fluorophores as well as 4x, 10x, 20x, 40x dry objectives plus 63x oil objective. The microscope is coupled to Leica DFC420 5MP colour and DFC360 1.4 MP monochrome camera, and utilises Leica LAS X software for obtaining and analysing images.

Zeiss Axio Observer Z1 inverted microscope

Zeiss Axio Observer Z1 inverted widefield microscope for brightfield and epifluorescence imaging with fluorescence filter sets for UV, Blue and Orange light excited fluorophores as well as 10x, 20x, 40x dry objectives plus 40x and 63x oil objectives. The microscope is coupled to Zeiss AxioCam MRm 1.4 MP monochrome and utilises ZEN blue 2012 software for obtaining and analysing images. For live cell imaging studies, the microscope is equipped with an incubation chamber (full enclosure) with a modular heating unit for Petri dishes, microscope slides, and 24-well plates and regulation of temperature and CO2 environment.

Zeiss LSM 710 confocal module

Zeiss LSM 710 confocal module coupled to Zeiss Axio Observer Z1 microscope equipped with 7 laser beams (405nm, 458nm 488nm 514nm 543nm, 594nm, 633nm) as well as 10x, 20x, 40x dry objectives plus 40x oil and 63x oil objectives and ZEN black 2012 software for obtaining and analysing images.

Zeiss PALM

Zeiss PALM microdissection system for non-contact sampling and capture of RNA, DNA and proteins as well as live single cell cloning and culture. This fully motorised system built on Zeiss Axio Observer Z1 inverted microscope is equipped 10x, 20x, 40x dry objectives for brightfield-only imaging and microdissection. Laser Microdissection and Pressure Catapulting (LPMC) is realised via 355 nm UV laser. The microscope is coupled to Hitachi HV-D30 and Zeiss AxioCam MRc5 5 MP colour cameras.

Leica CM1950 cryostat

Leica CM1950 cryostatic microtome with UVC disinfection and Ag-protect system for the manipulation of potentially dangerous specimens. The cryostat is semi-automatic with 15 plate positions, working temperature range from 18 °C to -42 °C, rapid freezing of samples to -52 °C and vacuum washing system to reduce direct manipulation of samples.

Leica M80 stereo microscope

Leica M80 stereo microscope for microdissections equipped with LED3000 RL ring illuminator, transmitted light base as well as KL1500 LCD spotlight illumination light source. The microscope is coupled to a stand-alone digital imaging system based on FLEXCAM C1 12 MP colour camera.

Image Processing Workstation

A workstation (CPU: 16 core Intel Xeon W5-2465X 4.50GHz, 256GB DDR5 ECC RAM, GPU: NVIDIA RTX A5000 24GB) designed to assist in handling large data sets and complex image processing tasks. It comes with SVI Huygens Professional commercial image processing and visualisation software as well as a number of open-source image processing applications.

Contactes institucionals / Cap de plataformes

DAVID IZQUIERDO
DAVID IZQUIERDOCap dels Serveis Científic-Tècnics
IGTP

Dades provisionals

Jakub Chojnacki | Entrenador |   microscopia@igtp.cat  | (+34) 93 033 0534 |

Jakub Chojnacki - Gerent

Carolina Gálvez Montón (Responsable) | Correu electrònic:   cgalvez@igtp.cat  | +34 935 543 050

Centres CERCA

Badalona, Spain

1995

IGTP

Propietaris

Llista Centres CERCA

Equipament i Serveis

Abberior INFINITY Des del maig de 2023, les instal·lacions de bioseguretat d'alt nivell (NCB3) del Centre de Medicina Comparativa i Bioimatge de Catalunya (CMCiB) allotgen Abberior Infinity, un microscopi confocal de superresolució d'última generació. Aquest microscopi està adaptat per a la imatge de cèl·lules vives i, gràcies a les seves capacitats de superresolució, és especialment adequat per estudiar detalls moleculars de les interaccions de patògens (virus, bacteris, paràsits) amb cèl·lules, organoides o teixits. Finalment, gràcies a la naturalesa oberta i fàcilment actualitzable d'aquesta plataforma, podrà créixer en funció de les necessitats dels usuaris i oferir en el futur modalitats addicionals com l'excitació de 2 fotons o la imatge intravital d'animals vius. L'equip d'aquesta classe, únic a la regió, és una eina potent per a estudis de microscòpia avançats sobre patògens de nivell 3 completament infecciosos (VIH, SARS-CoV-2, verola del mico, tuberculosi, etc.). Està disponible per a tots els usuaris interns i externs a través de la plataforma de microscòpia IGTP. Abberior STEDYCON Aquest microscopi és un microscopi confocal compacte i de superresolució capaç d'imatges de 4 colors en modes de superresolució confocal i STED (resolució de fins a 40 nm). L'STEDYCON està acoblat a un cos Olympus IX83 totalment motoritzat equipat amb il·luminació d'epifluorescència de banda QUAD, així com objectius en sec de 10x, 20x més objectius en oli de 40x i 63x. El programari STEDYCON per obtenir i analitzar imatges també inclou el programari SVI Huygens Pro per a l'unió i la deconvolució ràpides d'imatges. Leica DMI6000B Microscopi invertit de camp ampli Leica DMI6000 B totalment motoritzat per a imatges de camp clar i fluorescència amb conjunts de filtres de fluorescència per a fluoròfors excitats per llum UV, blava i taronja, així com objectius en sec de 4x, 10x, 20x, 40x més un objectiu en sec d'oli de 63x. El microscopi està acoblat a les càmeres en color Leica DFC420 de 5 MP i monocrom DFC360 d'1.4 MP, i utilitza el programari Leica LAS X per obtenir i analitzar imatges. Zeiss PALM Un sistema de microdissecció per al mostreig i la captura sense contacte d'ARN, ADN i proteïnes, així com per a la clonació i el cultiu de cèl·lules individuals vives. Aquest sistema totalment motoritzat, basat en el microscopi invertit Zeiss Axio Observer Z1, està equipat amb objectius en sec de 10x, 20x i 40x per a imatges només de camp clar i microdissecció. La microdissecció làser i la catapultació a pressió (LPMC) es realitza mitjançant un làser UV de 355 nm. El microscopi està acoblat a les càmeres en color Hitachi HV-D30 i Zeiss AxioCam MRc5 de 5 MP. Microscopi invertit de camp ampli Zeiss Axio Observer Z1 per a imatges de camp clar i epifluorescència amb conjunts de filtres de fluorescència per a fluoròfors excitats per llum UV, blava i taronja, així com objectius en sec de 10x, 20x, 40x més objectius en oli de 40x i 63x. El microscopi està acoblat al Zeiss AxioCam MRm 1.4 MP monocrom i utilitza el programari ZEN blue 2012 per obtenir i analitzar imatges. Per a estudis d'imatges de cèl·lules vives, el microscopi està equipat amb una cambra d'incubació (recinte complet) amb una unitat de calefacció modular per a plaques de Petri, portaobjectes de microscopi i plaques de 24 pous i regulació de la temperatura i l'entorn de CO2. Criòstat Leica CM1950 Un micròtom criostàtic amb desinfecció UVC i sistema de protecció amb àcid orgànic per a la manipulació d'espècimens potencialment perillosos. El criòstat és semiautomàtic amb 15 posicions de placa, rang de temperatura de treball de 18 °C a -42 °C, congelació ràpida de mostres fins a -52 °C i sistema de rentat al buit per reduir la manipulació directa de mostres. Leica M80 Un microscopi estereògraf per a microdisseccions equipat amb un il·luminador d'anell LED3000 RL, una base de llum transmesa i una font de llum d'il·luminació LCD KL1500. El microscopi està acoblat a un sistema d'imatges digitals autònom basat en la càmera en color FLEXCAM C1 de 12 MP. Estació de treball de processament d'imatges Una estació de treball dedicada (CPU: Intel Xeon W5-2465X de 16 nuclis a 4,50 GHz, 256 GB de RAM ECC DDR5, GPU: NVIDIA RTX A5000 de 24 GB) dissenyada per ajudar a gestionar grans conjunts de dades i tasques complexes de processament d'imatges. Inclou el programari de processament i visualització d'imatges comercials SVI Huygens Professional, així com diverses aplicacions de processament d'imatges de codi obert.

La plataforma de microscòpia IGTP ofereix els serveis següents: Microscòpia confocal i de camp ampli automatitzada Imatges confocal o de camp ampli de cèl·lules vives Microscòpia de superresolució STED Imatges espectrals Espectroscòpia de correlació de fluorescència (FCS i STED-FCS) Processament i anàlisi d'imatges Serveis complementaris La plataforma de microscòpia IGTP també ofereix suport i assessorament complets per al disseny, l'execució i l'anàlisi de dades d'experiments basats en microscòpia, així com formació en l'ús eficient i responsable dels equips de microscòpia.

Categorització

Dominis RIS3CAT

Dominis RIS3CAT
CERCA GINYS Categories

GINYS-IGTP-005

Procediment d'accés i tarifes

Open_x000D_ _x000D_ Horari d'obertura de 09:00 a 18:00 de dilluns a divendres

Xarxes institucionals