Plataforma bioinformàtica

La Unitat de Bioinformàtica (IBU) de l'IDIBELL va iniciar l'activitat el 2018. La seva missió és proporcionar a tots els investigadors del Campus de Bellvitge consultoria científica, suport metodològic i recursos tecnològics sobre bioinformàtica per tal de millorar tant el nombre com la qualitat dels projectes de recerca on hi hagi dades òmiques. També oferim serveis estàndard a la comunitat externa. El nostre personal té més de 15 anys d'experiència en disseny experimental, anàlisis òmiques i integratives de dades, gestió de bases de dades i ontologies, desenvolupament de pipelines i eines, així com una llarga experiència en la docència d'activitats d'educació i formació formal en els camps de les dades òmiques i la bioinformàtica.

Contactes institucionals / Cap de plataformes

Dades provisionals

Jose Luis Mosquera | Head of Unit |  bioinformatics@idibell.cat  |  ORCID 

Jose Luis Mosquera | Head of Unit |  bioinformatics@idibell.cat  |  ORCID 

Centres CERCA

Propietaris

Llista Centres CERCA

Equipament i Serveis

Actualment, els recursos informàtics de la unitat consten de 2 estacions de treball HP Z240: 8 CPU Intel Core i7-770, 3,60 GHz, 64 GB de RAM, 4 TB de disc dur HP Z2 G4: 8 CPU Intel Core i7-8700k, 3,70 GHz, 64 GB de RAM, 2 TB de disc dur 2 ordinadors de sobretaula HP ProDesk 600 G3 MT: 8 CPU Intel Core i7-770, 3,60 GHz, 64 GB de RAM, 2 TB de disc dur DELL D05D001: 4 CPU Intel Core i5-2400, 3,40 GHz, 6 GB de RAM, 250 GB de disc dur 1 ordinador portàtil MackBook Air: Intel Core i5 de doble nucli, 1,6 GHz, 8 GB de RAM, SSD de 128 GB 1 ordinador Sorage Synology Rackstation RS820RP+ connectat a la xarxa, 24 TB de disc dur

Assistim els investigadors proporcionant: Consultoria Disseny experimental Metodologia bioinformàtica Programari bioinformàtic Sol·licitud de subvencions: pressupost del servei, mida de la mostra, planificació de mètodes, etc. Servei personalitzat Anàlisi de dades Dades òmiques: genòmica, transcriptòmica, epigenòmica, proteòmica, etc. Mineria i anàlisi de dades mitjançant conjunts de dades públics Combinació d'informació clínica o biomèdica amb dades òmiques Construcció de models de predicció/classificació mitjançant tècniques d'aprenentatge Desenvolupament de programari Fluxos de treball o pipelines Bases de dades i ontologies Eina personalitzada Activitats de formació

Categorització

Dominis RIS3CAT

Dominis RIS3CAT
CERCA GINYS Categories

GINYS-IDIBELL-009

Procediment d'accés i tarifes

Obre

Xarxes institucionals