Plataforma de genòmica i transcriptòmica

La plataforma de Genòmica i Transcriptòmica és una instal·lació bàsica centrada en l'assessorament, l'oferta de serveis específics en tècniques de genòmica o transcriptòmica i la posada a disposició dels investigadors i la comunitat científica d'equips específics.

Contacte principal

Contactes institucionals / Cap de plataformes

JC

Javier CrespoDirector de gestión de infraestructuras
Institut de Recerca Sant Pau

Dades provisionals

Sandra Camino López -

Sandra Camino López

Javier Crespo | Supervisor responsable |   jcrespo@santpau.cat  

Centres CERCA

Barcelona, Spain

1992

Institut de Recerca Sant Pau

Propietaris

Llista Centres CERCA

Equipament i Serveis

Equipament específic Plataforma de matrius del sistema Affymetrix GS 3000 (actualització 7G). Sistema de PCR en temps real ràpid 7900HT (blocs de 96 pous, 384 pous i TLDA) (AB-ThermoFisher Sci) Bioanalyzer 2100 (Agilent Tech). Nanodrop 2000 (ThermoFisher Sci). Qubit 3.0 (ThermoFisher Sci) Lector de microplaques Infinite M200 PRO (Tecan): espectrofotòmetre, fluorímetre, luminòmetre. Seqüenciador d'electroforesi capil·lar 3130xl Genetic Analyzer (ThermoFisher Sci). Sistema de seqüenciació de nova generació Ion GeneStudio S5, amb sistema Ion Chef (ThermoFisher Sci).

Concretament, GT Platform ofereix els serveis següents: Quantificació i control de qualitat de mostres d'àcids nucleics (Qubit 3.0, Nanodrop 2000 i Bioanalyzer 2100) Processament de mostres per a estudis de microarrays (expressió gènica, perfils de miRNA, citogenètica, GWAS) Projectes de PCR en temps real (expressió gènica, detecció de miRNA, discriminació al·lèlica, CNV, quantificació absoluta...) Seqüenciació de nova generació: seqüenciació d'exomes, seqüenciació d'ARN o ADN dirigits (tecnologia Ampli-Seq), seqüenciació de petits ARN, seqüenciació de novo, ChiP-Seq, seqüenciació 16S, metagenòmica... Seqüenciació Sanger: seqüenciació d'ADN, anàlisi de mutacions i polimorfismes, estudis de metilació d'ADN, identificació de microorganismes... Anàlisi de fragments: autenticació de línies cel·lulars, nombre de còpies (MLPA), LOH, estudis de genotipatge, inestabilitat de microsatèl·lits, estudis d'expansió de repeticions d'ADN... Anàlisi de dades òmiques Alguns dels equips utilitzats per dur a terme aquestes tècniques poden ser accessibles per als investigadors després d'una formació específica d'usuaris.

Categorització

Dominis RIS3CAT

Dominis RIS3CAT
CERCA GINYS Categories

GINYS-IRSP-005

Procediment d'accés i tarifes

Obert. Consulta les condicions

Qualitat institucional