Bioinformática

La unidad proporciona procesamiento y análisis de datos para microarreglos de datos genómicos, epigenómicos y transcriptómicos y secuenciación de alto rendimiento Microarreglos Genoma Paneles SNV QC, llamada de variante Agrupamiento de genotipo personalizado Epigenoma Metilación de ADN (450K, EPIC) • QC, Estandarización • Llamada de metilación (valores beta/M) • Clúster • Metilación diferencial (DM/DMR) • Gen + Asociación de elementos reguladores Transcriptoma Matrices de expresión génica • QC, Normalización • Cuantificación • Clúster • Expresión diferencial • Análisis del enriquecimiento del conjunto genético Matrices de microARN • QC, Estandarización • Cuantificación • Clúster • Expresión diferencial • Predicción de diana • Correlación de expresión génica-miARN Secuenciación de alto rendimiento Genoma Secuenciación del genoma completo (WGS) Secuenciación del exoma QC, Llamada de alineación variante Epigenoma ChIP-seq, ATAC-seq, DNAse-seq QC, Llamada de alineación tap Enlace diferencial Análisis funcional Genoma completo Secuenciación de bisulfito (WGBS), Análisis de Representación Reducida Secuenciación por Bisulfito (RRBS) QC, Cartografía Llamada de metilación Llamada de variante Análisis diferencial (DMR / segmentación de metiloma) Anotación funcional Transcriptoma RNAseq (poli +/-, total) QC, cartografía • Cuantificación Splicing alternativo Cluster Expresión diferencial Análisis del enriquecimiento del conjunto genético Otros servicios de consultoría Diseño experimental Asesoramiento estadístico Análisis de recomendaciones y herramientas de flujo de trabajo Formación Prácticas Seminarios Talleres

GINYS-IJC-005

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