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Centros CERCA

Badalona, Spain
2010
Institut de Recerca Contra la Leucèmia Josep Carreras (IJC)
Propietarios
CJI
Equipos y Servicios
Sistema 10x Genomics Chromium™ (10x genomics) La unidad está equipada con un instrumento Chromium Controller. Esta tecnología se basa en microfluídica y permite la generación en paralelo de particiones de células individuales o núcleos con códigos de barras identificativos y la preparación de bibliotecas de secuenciación. – Expresión génica 3′ del transcriptoma de una sola célula – ATAC de célula única de cromo (ensayo para cromatina accesible a la transposasa) – ATAC multioma de célula única de cromo + Transcriptómica espacial de expresión génica – Visium (10x genomics) 10x Genomics ha desarrollado un flujo de trabajo para secuenciar ARNm sin pérdida de información espacial. La solución Visium Spatial Gene Expression permite el transcriptoma completo y el análisis dirigido del ARNm mediante secuenciación de alto rendimiento y, posteriormente, mapea el patrón de expresión de una transcripción en secciones de tejido mediante imágenes microscópicas de alta resolución. Plataforma Tapestri (Mission Bio) La plataforma Tapestri está diseñada para la secuenciación dirigida de células individuales. La plataforma está diseñada para producir bibliotecas de secuenciación de scDNA dirigidas, ya sea de forma independiente o en una solución multiómica que combina el análisis de ADN y proteínas dirigidos de células individuales. Mission Bio ofrece la posibilidad de utilizar paneles de ADN y proteínas prediseñados o personalizados. -Secuenciación de ADN dirigida de células individuales con Tapestri -Secuenciación de ADN y proteínas dirigida de células individuales con Tapestri Análisis de datos. La genómica unicelular y espacial permite la caracterización completa de las células en cuanto a su identidad y función. Sin embargo, los datos de células individuales son ruidosos y presentan diversos desafíos computacionales y analíticos, que requieren la aplicación de herramientas diseñadas específicamente para su análisis. La unidad brindará soporte para el análisis bioinformático de datos de células individuales.
Proporcionamos apoyo científico y tecnológico a proyectos de investigación de alto nivel en el campo de la secuenciación de células individuales, según procedimientos internacionales estándar. Ofrecemos asesoramiento científico a investigadores, desde la planificación y optimización de nuevos experimentos hasta su ejecución y análisis bioinformático. Contribuimos a la promoción de la innovación en tecnologías sanitarias y a la transferencia del conocimiento generado al Sistema Nacional de Salud (NHS).
Categorización
Dominios RIS3CAT y otros
Sistema Social y de Salud
Sistema industrial
Sistema de educación y generación de conocimiento
EQUIPO TECNOLÓGICO
Citometría
Genómica
Otros laboratorios especializados
GINYS-IJC-002
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