Citometría

La plataforma de Citometría se creó en 1999 como servicio de apoyo a la investigación dentro del Instituto de Investigación Germans Trias i Pujol, en el campus de Can Ruti de Badalona. Además, presta un servicio de diagnóstico clínico en Inmunología en el Hospital Germans Trias i Pujol e imparte cursos anuales de formación en citometría de flujo. La plataforma ofrece servicios de separación, análisis y adquisición de células en citómetros de flujo, consultoría y formación. Desde febrero de 2006, la plataforma de Citometría se ubica en la planta baja del edificio Mar del IGTP. Consta de 64 m², distribuidos en un laboratorio exclusivo para el uso del separador celular y un espacio dedicado a los analizadores de citómetros de flujo, así como una zona informática para análisis fuera de línea.

Bloques de contenido

High-Dimensional Spectral Cytometry

High-Dimensional Spectral Cytometry

Aurora 5-laser (Cytek Biosciences)

Configured with five lasers (355, 405, 488, 561 and 640 nm), three scatter parameters and 64 fluorescence channels, Aurora allows high dimensional data with designed panels (40-colors simultaneously and beyond). Equipped with Automatic Micro-sampling System (AMS) for high throughput acquisition with 96-well plates. Data analysis with SpectroFlo software for unmixing spectral raw data.

Flow Cytometer Analysers

Flow Cytometer Analysers

Flow Cytometer LSRFortessa SORP (BD Biociencias)

Equipped with solid state blue laser (488nm), red laser He-Ne (640 nm), violet laser (405 nm) and green laser (532 nm) this machine allows you to work with 18 fluoresences and 2 scatter parameter (FSC and SSC) analysing area, height and width of pulse for each one. Digital system processing system with software FACSDiva. HTS system for acquiring samples in 96 well plates.

Flow Cytometer FACSCanto II (BD Biociencias)

Solid state blue laser (488 nm), red He-Ne laser (633 nm) and violet laser (405 nm). This machine can work with eight fluorescences and two dispersion parameters (FSC and SSC) analysing area, height and width. Digital system processing system with FACSDiva software. This program permits off-line compensation and the configuration of biexponential scales.

Flow Cytometer FACSLyric (BD Biosciences)

Equipped with Solid state red He-Ne laser (633 nm) and violet laser (405 nm), this machine collects 10 parameters (FSC, SSC and 8 fluorescences¡ channels). It has an automatic loader for tubes and plates. It includes volume computation and uses FACSuite software.

Luminex® 200 (Luminex Corp.)

Luminex® 200 System is a flexible analyzer based on the principles of flow cytometry. Luminex® 200 sets the standard for multiplexing and offers the ability to perform up to 100 different tests in a single reaction volume and use either magnetic beads or plain polystyrene beads. The equipment performs higher sample throughput with a 96-well plate read time of only 45 minutes.

Off-line analysis software

Off-line analysis software

Software

FlowJo, BD FACSDiva and CellQuestPro are installed in Apple iMac Intel i7 16 GB RAM with MAC OSX and Windows (XP y 7) systems. Workstation with Windows10.

Cell Sorters

Cell Sorters

The FACSAria II (BD Biociencias) cell separator

Three lasers (405, 488 y 633 nm), 13 fluorescent detectors (13 fluorescent and 2 light scattering). ACDU (Automated Cell Deposition Unit) for sorting different types of well plates and slides. Options installed: aerosol evacuation system (AMO) and refrigerated bath temperature control. Software FACSDiva. Sorting speed >20.000 cells/sec.

Bigfoot Spectral Sorter

The detection system is equipped with 5 lasers (346nm, 405nm, 488nm, 561nm, and 640nm) and a total of 53 detectors, 5 of which are dedicated to FSC and SSC scatter parameterization. It also has light depolarization filters for SSC scatter parameters on the blue laser.

The Bigfoot software allows working in both conventional and spectral modes and is housed within a class II biosafety cabinet with an aerosol extraction system featuring HEPA filters.

The cell sorting module consists of a jet-in air system and is equipped with 70, 100, 120, and 150 micrometer nozzles. Collection can be performed in 1.5mL eppendorf tubes, 5mL tubes, 15mL and 50mL falcon tubes. It is also possible to collect in various types of plates, allowing simultaneous 4-way sorting in a 96-well plate. Both the acquisition and collection ports are independently temperature controlled (4-37°C).

Contactos Institucionales / Responsable de Plataformas

DAVID IZQUIERDO
DAVID IZQUIERDOCap dels Serveis Científic-Tècnics
IGTP

Contactos temporales

Carolina Gálvez Montón (Responsable) | Correo electrónico:   cgalvez@igtp.cat  | +34 935 543 050

Centros CERCA

Badalona, Spain

1995

IGTP

Propietarios

Lista Centros CERCA

Equipos y Servicios

Separación celular: Separador celular FACSAria II (BD Biosciences). Tres láseres (405, 488 y 633 nm), quince detectores (trece fluorescencias y dos parámetros de dispersión de luz). Unidad de Deposición Celular Automatizada (ACDU) para la separación en diferentes tipos de placas de pocillos y portaobjetos; opción de celda individual. Opciones instaladas: sistema de evacuación de aerosoles (AMO) y control de temperatura para baño refrigerado. Software FACSDiva. Analizadores de citómetros de flujo: Citómetro de flujo LSRFortessa SORP (BD Biosciences). Equipado con láser azul de estado sólido (488 nm), láser rojo de He-Ne (640 nm), láser violeta (405 nm) y láser verde (532 nm), permite trabajar con 18 fluorescencias y dos parámetros de dispersión (FSC y SSC), analizando para cada uno el área, la altura y la anchura del pulso eléctrico. Procesamiento, adquisición y análisis de señales digitales con el software FACSDiva. Sistema HTS para la adquisición de muestras con placas de 96 pocillos. Separador de células FACSLyric (BD Biosciences). Equipado con láser azul de estado sólido (488 nm), láser rojo de He-Ne (633 nm) y láser violeta (405 nm), permite trabajar con diez fluorescencias y dos parámetros de dispersión (FSC y SSC). Sistema de procesamiento digital de señales con el software BD FACSSuite. Equipado con cargador de muestras automático para tubos y placas de 96 pocillos. Citómetro de flujo FACSCanto II (BD Biosciences). Equipado con láser azul de estado sólido (488 nm), láser rojo de He-Ne (633 nm) y láser violeta (405 nm), permite trabajar con ocho fluorescencias y dos parámetros de dispersión (FSC y SSC). Sistema de procesamiento digital de señales con el software FACSDiva. Equipado con cargador de muestras automático para tubos (Loader). Luminex® 200 (Luminex Corp.). El sistema Luminex® 200 es un analizador basado en los principios de la citometría de flujo. Luminex® 200 establece el estándar de multiplexación y ofrece la capacidad de realizar hasta 100 pruebas diferentes en un solo volumen de reacción y utilizar microesferas magnéticas o de poliestireno. Ofrece un excelente rendimiento de muestra con un tiempo de lectura de placa de 96 frascos de tan solo 45 minutos. Programas para análisis fuera de línea: Software FlowJo, FACSDiva y CellQuestPro instalados en una computadora iMac de 27 pulgadas con Intel i7 y 16 GB de RAM, con sistemas operativos MAC OSX y Windows (XP y 7). Citometría espectral de alta dimensión: Aurora 5-laser (Cytek Biosciences). Instalado en mayo de 2020, está configurado con cinco láseres (355, 405, 488, 561 y 640 nm), tres parámetros de dispersión y 64 canales de fluorescencia. Aurora permite obtener datos de alta dimensión con paneles diseñados (40 colores simultáneos y más). Equipado con un sistema automático de micromuestreo (AMS) para la adquisición de alto rendimiento con placas de 96 pocillos. Análisis de datos con el software SpectroFlo para diferenciar los datos espectrales brutos.

Separación celular. Los citómetros de flujo con separador (FACSAria II) permiten separar las células según parámetros definidos previamente por el operador. Para purificar diferentes poblaciones celulares, la citometría de flujo está especialmente diseñada para aplicaciones que requieren una alta pureza de la muestra. El uso simultáneo de múltiples fluorocromos permite clasificar y separar subpoblaciones celulares según la expresión de diferentes propiedades celulares. La preparación del experimento de separación celular requiere una serie de pasos previos que deben especificarse previamente con el responsable de la Plataforma de Citometría. Adquisición y análisis con los citómetros analizadores de flujo BD FACSCanto II, BD FACSLyric y BD LSR Fortessa son los citómetros analizadores que el usuario puede utilizar para realizar diferentes estudios. Estos equipos pueden ser utilizados directamente por el usuario, ya sea acreditando experiencia en el manejo de los mismos o mediante un curso previo impartido por el personal de la Plataforma de Citometría. Además, el separador celular FACSAria II puede utilizarse como citómetro analizador, especialmente cuando se necesitan más detectores de fluorescencia. Análisis sin conexión en entornos Mac/Windows con el software FACSDiva y FlowJo, compensación sin conexión y escalas toponenciales o “Logicle” y ModFit. Formación: Diseño de cursos personalizados. Anualmente se imparten en el IGTP varios cursos sobre los fundamentos y aplicaciones de la citometría de flujo. Consultoría: La plataforma de citometría ofrece a los usuarios un servicio de consultoría sobre temas relacionados con la citometría de flujo.

Categorización

Dominios RIS3CAT y otros

Dominios RIS3CAT
Categorías de CERCA GINYS

GINYS-IGTP-002

Procedimiento de acceso y tarifas

Abierto

Redes institucionales