
Computación de alto rendimiento (HPC)
Bloques de contenido
Explorador de células - Revity
Echo 650 - Beckman Coulter


Dispensador Multidrop - Thermo


Estación de trabajo robótica de laboratorio Hamilton Vantage - Hamilton


Congelador automático Q50 - Hamilton


Contactos Institucionales / Responsable de Plataformas

Contactos temporales
Centros CERCA

Badalona, Spain
1995
IGTP
Propietarios
IGTP
Equipos y Servicios
El centro de distribución cuenta con un sistema de ventilación rotativa con redundancia integrada, además de un SAI capaz de mantener el suministro eléctrico a todos los servidores durante varios minutos (más de 30) y múltiples líneas de alimentación para cada rack. Como medida de protección contra incendios, el CPD cuenta con un sistema automático de extinción de incendios por gas trifluorometano. Clúster de cálculo 16 nodos de cálculo que dan un total de: 240 Núcleos 2 Tb RAM 1 Tb de almacenamiento local (1Tb/nodo) Formado por tres tipos de nodos diferentes: HP DL160 G6: 8 Núcleos (Xeon E5640) y 64 GB RAM (x8) Fujitsu RX200 S7: 12 Núcleos (Xeon E5-2640) y 120 GB RAM (x3) HP DL 360 G9: 28 Núcleos (Xeon E5-2680 v4) y 256 GB RAM (x5) Sistema de almacenamiento El sistema de almacenamiento principal es un Isilon (Dell/EMC) Gen 6 de alta disponibilidad con cuatro nodos H400 y cuatro nodos A200. Capacidad de almacenamiento utilizable 450Tb Sistema de instantáneas disponible para los usuarios Sistema de instantáneas accesibles para los usuarios El sistema proporciona un sistema de archivos unificado para todos los usuarios y está disponible desde los nodos de cómputo o desde las estaciones de trabajo, lo que simplifica el trabajo de los investigadores. Copia de seguridad/Recuperación de datos El sistema de copia de seguridad/recuperación de datos está compuesto por: Librería HPE 4048 con dos unidades LTO-7 y capacidad para 48 cintas (capacidad de 768 Tbs) Quantum Scalar i80 dos unidades LTO-5 con capacidad para 50 cintas Ambas librerías están administradas por el software de copia de seguridad Bacula La librería principal (HPE 4048) es para copias de seguridad de datos para grupos, máquinas virtuales, bases de datos y datos almacenados a largo plazo. La librería secundaria (Quantum Scalar i80) se ocupa de copias redundantes de máquinas virtuales y trabajos archivados en cinta LTO-5. El sistema realiza copias de seguridad diarias de los datos y con una política de retención de datos predeterminada de 3 meses. Los trabajos de copia de seguridad de archivo se mantienen indefinidamente. Red: La red del centro de datos está compuesta por tres switches 3com 4210G de 1 GB y tres switches HPE 5700 de 10 GB. Los switches y las conexiones a las máquinas están configurados para alta disponibilidad. El sistema de almacenamiento Isilon, el sistema de respaldo principal y los nodos de cómputo DL 360 están conectados a través de 10 GB; el resto del clúster utiliza 1 GB con interfaces agregadas.
Mantenimiento y soporte de las instalaciones Garantizar que la infraestructura informática esté funcionando 24/7 Instalación y gestión del sistema operativo (GNU/Linux) en todas las máquinas del área de computación científica Instalación y gestión del sistema de cluster para el área de computación científica Instalación, mantenimiento y actualización de software científico Gestión de la infraestructura de discos del área científica Gestión de la infraestructura de red del equipo científico Gestión de la infraestructura de backup y estrategia de recuperación de datos Instalación y gestión de diversos servidores y servicios (incluidos, entre otros:) Gestión e instalación de servidores web privados y públicos y servicios Instalación y gestión de bases de datos Servicios FTP(S) Sistema de control de versiones interno (gitlab) Herramientas de monitorización para ajuste de rendimiento y alertas Sistema de colas (SGE) Seguridad del sistema (endurecimiento, auditoría, parcheo) Asesoramiento a bioinformáticos en tareas computacionales Computación de alto rendimiento Asesorar y ayudar a diseñar pipelines bioinformáticos Asesoramiento en compra de hardware para bioinformática Acceso abierto al Portal de Bioinformática Acceso abierto a herramientas desarrolladas por el IGTP Herramientas Maplab (trazador de metilación, ontología Alu, Wanderer, Chainy, TrukeTCGA 450k trackhub) Islet Regulome Alta ferritina TOROS
Categorización
Dominios RIS3CAT y otros
Sistema Social y de Salud
Sistema industrial
Sistema de educación y generación de conocimiento
TECNOLOGÍAS DE LA INFORMACIÓN
Computación de alto rendimiento (HPC)
Sistemas de información
GINYS-IGTP-003
Procedimiento de acceso y tarifas
Calidad Institucional
Redes institucionales