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Equipos y Servicios
Consta de dos áreas: transcriptómica y secuenciación de nueva generación (NGS), y ofrece servicios que van desde el control de calidad de ADN y ARN mediante plataformas como Synergy2, Nanodrop1000, Qubit 2.0 o TapeStation 4200 hasta tecnologías más complejas. En el área de transcriptómica, existen dos plataformas de arrays de Affymetrix: GeneTitan, que permite realizar transcritos de genoma completo o GWAS en formato de placa (16, 24 y 96 muestras), y la plataforma GeneChipSystem, que permite trabajar con formatos más pequeños e individuales, además de analizar perfiles transcripcionales de genoma completo y análisis de dosis génica. También está disponible la plataforma nCounter de Nanostring para el análisis de expresión génica o perfiles de dosis, una tecnología que ofrece muy buenos resultados en muestras extraídas de FFPE. También existe la plataforma qPCR, BioMark de Fluidigm, una PCR en tiempo real que permite el análisis de expresión, número de copias y PCR digital. El área de NGS cuenta con la plataforma MiSeq, donde se desarrollan proyectos de secuenciación de paneles de genes o microbiomas. Recientemente se ha incorporado un NextSeq 2000 para integrar RNASeq, WES, análisis de paneles de genes y protocolos de microbioma. También se dispone de un fragmentador, Covaris S220, para preparar muestras para su posterior procesamiento, y un piromarcador, Pyromark Q24, para analizar la presencia de un alelo o el estado de metilación. Finalmente, se dispone de un robot de líquidos, Biomek FX de Beckman, con dos cabezales, uno para 96 y otro para 8 muestras, para automatizar diferentes tecnologías. EQUIPO Synergy2 NanoDrop 1000 Qubit 2.0 Bioanalyzer 2100 (Agilent) TapeStation 4200 (Agilent) BioMark (Fluidigm) nCounter FLEX (Nanostring) Sistema GeneChip (Affymetrix) Sistema de análisis genético GeneTitan (Affymetrix) Robot de líquidos Biomek FX (Beckman) Plataforma de análisis de microarrays (Agilent) PyroMark Q24 (QIAGEN) Covaris S220 MiSeq (Illumina) NextSeq 2000 (Illumina)
Cuantificación de ácidos nucleicos por absorbancia (Nanodrop) o fluorimetría (Qubit) Análisis de calidad de ácidos nucleicos y obtención de datos RIN o DIN (Bioanalyzer 2100 y TapeStation 4200, Agilent) Análisis de expresión y genotipado por PCR de baja densidad en tiempo real (BioMark, Fluidigm) PCR digital (BioMark, Fluidigm) Cuantificación digital de ácidos nucleicos (nCounter, Nanostring) Análisis de expresión génica (GE) y variaciones en el número de copias (CNV) mediante microarrays (GeneChip System, Affymetrix) Análisis de expresión génica (GE) y genotipado (GWAS) de alta densidad (GeneTitan, Affymetrix) CGH-Arrays (Agilent) Fragmentación de ácidos nucleicos y cromatina (Covaris S220) Pirosecuenciación (PyroMark Q24, QIAGEN) Generación de librerías por NGS Secuenciación de nueva generación (MiSeq, Illumina)
Categorización
Dominios RIS3CAT y otros
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Sistema industrial
Sistema de educación y generación de conocimiento
EQUIPO TECNOLÓGICO
Genómica
Secuenciación
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Calidad Institucional
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