Metabolómica

El centro ofrece consultoría y servicios en áreas de estudio que requieren técnicas de proteómica o metabolómica basadas en espectrometría de masas. Configuramos el análisis de metabolitos mediante perfiles diferenciales o dirigidos (moléculas específicas) en cualquier tipo de fluido o tejido biológico, incluyendo la exhalación respiratoria. Perfeccionamos cualquier nueva prueba en estos dos campos que requieran nuestros clientes. La actividad del Centro de Proteómica y Metabolómica se basa en la colaboración con investigadores para perfeccionar la técnica necesaria, analizar muestras y preparar los resultados. Nos centramos en el campo biomédico: la identificación y validación de biomarcadores y los mecanismos de enfermedades mediante perfiles de expresión proteica, modificaciones postraduccionales e interacciones proteína-proteína.

Bloques de contenido

Spectrometers

Spectrometers

Hybrid Mass Spectrometer Q-TOF Micro ESI-QqTOF MS and Nano HPLC (Agilent serie 1200™)

QqT Hybrid spectrometer coupled to a nano liquid chromotagraph for identification of peptides and proteins. It can also carry out metabolite analysis in linear mode. Nominal resolution of 20,000. It is used in tandem mode to identfiy peptides in single mode for quantification for profile analyses.

Software:

- Compass server - HyStar 3.2 - MicrOTOF Control - Data Analysis - Sequence Editor - Metabolite Detect - Library Editor - Quant Analysis - Profile Analysis Integrated with ProteinScape

MS/MS with attachment for ISD experiments (In SourceDecay)

Triple Quadruple Mass Spectrometer ESI- QQQ MS (Agilent™ 6410 BA) and uPLC quaternary (Agilent™ 1260 Infinity)

Spectrometer coupled to uPLC for metabolite quantification in MRM mode (multiple reaction monitoring). Also operates in four other operation modes, SIM (single ion monitoring), ion precursors, ion fragments, neutral losses.

Software

- Mass Hunter Data Adquisition - Mass Hunter QualitativeAnalysis - Mass Hunter QuantitaveAnalysis

Gas Cromatograph coupled to Mass Spectometer

GC/EI+Ci+Ci-/MS (GC series™ con MD800™ y AS2000™ Thermo Instruments).

– Softwares: MassLab con librerías NIST y WiLLEY

Thermal desorption for volatiles (MW-1A™ Rektorik)

Gas chromatograph FID (flame ionization)

- GC/FID (AutoSystem™ Perkin Elmer)

Software

Clarity (6 channels)

MALDI TOF/TOF Autoflex Speed TOF/TOF

Mass spectrometer MALDI with nominal resolution for 20.000 para peptides

Capability for experiments in MS, MS/MS and three MS masses for protein molecular weights - MS/MS with attachment for ISD (In SourceDecay) - MS/MS with attachment LIFT peptide sequencing, glycans - MS/MS/MS with attachment CID + LIFT for high energy fragmentation for sequencing protein terminals e fragmentación a alta energía para

Equipment integrated with the platform: - Compass - Clinprot - ClinPro Tools 2.2 - Bio Tools 3.1 - Nano-MALDI - WARP-LC - MASCOT versión 2.5

Software: FlexControl, Flex Imaging, ProteinScape Imageprep – Attachment for tissue sample preparation for MALDI imaging

Analytical and Preparative Liquid Chromatographs

Analytical and Preparative Liquid Chromatographs

HPLC quatenary pump with UV/vis Detector and Column Heater

(Waters™ 600 series)

Software

ClarityClarity (6 channels)

FPLC Äkta purifier™ (GE Healthcare)

FPLC for protein purification

Software

Unicorn

HPLC alliance™ 2695 (Waters) con detectores 2996 UV/vis y desviación del índice de refracción 2414FPLC

Software

Empower

HPLC alliance™ 2695 (Waters) con detectores 2996 UV/vis y fluorescencia 2475

Software

Empower

Contactos Institucionales / Responsable de Plataformas

DAVID IZQUIERDO
DAVID IZQUIERDOCap dels Serveis Científic-Tècnics
IGTP

Contactos temporales

José María Hernández Pérez-

José María Hernández Pérez-

Carolina Gálvez Montón (Responsable) | Correo electrónico:   cgalvez@igtp.cat  | +34 935 543 050

Centros CERCA

Badalona, Spain

1995

IGTP

Propietarios

Lista Centros CERCA

Equipos y Servicios

Espectrómetros Espectrómetro de masas híbrido Q-TOF Micro ESI-QqTOF MS y Nano HPLC (Serie Agilent 1200™) Espectrómetro híbrido QqT acoplado a un nanocromatógrafo líquido para la identificación de péptidos y proteínas. También puede realizar análisis de metabolitos en modo lineal. Resolución nominal de 20.000. Se utiliza en modo tándem para identificar péptidos en modo simple para cuantificación para análisis de perfiles. Espectrómetro de masas triple ESI-QQQ MS (Agilent™ 6410 BA) y uPLC cuaternario (Agilent™ 1260 Infinity) Espectrómetro acoplado a UPLC para la cuantificación de metabolitos en modo MRM (monitorización multirreacción). También funciona en otros cuatro modos de operación, SIM (monitorización de ion único), precursores de iones, fragmentos de iones, pérdidas neutras. Cromatógrafo de gases acoplado al espectrómetro de masas GC/EI+Ci+Ci–/MS (serie GC™ con MD800™ y AS2000™ de Thermo Instruments). Agente desorbente térmico para aves (MW-1A™ Rektorik) Cromatógrafo de gases FID (ionización de llama) MALDI TOF/TOF Autoflex Speed ​​​​TOF/TOF – Espectrómetro de masas MALDI con resolución nominal para 20.000 parapéptidos Cromatógrafos líquidos analíticos y preparativos Bomba cuaternaria HPLC con detector UV/tornillo y calentador de columna (Waters Series™ 600) Purificador FPLC Äkta™ (GE Healthcare) HPLC alliance™ 2695 (Waters) con 2996 detectores UV/vis y desviación del índice de refracción 2414FPLC HPLC alliance™ 2695 (Waters) con 2996 detectores UV/vis y 2475 detectores de fluorescencia

Servicios de metabolómica Perfiles de metabolitos de todo tipo (volátiles, semivolátiles y no volátiles, polares y no polares) generalmente para el descubrimiento de biomarcadores Análisis GC/MS (Thermo GC8060 MD800 EI+, CI-, CI+) ESI-QqTof MS Perfil LC/MS Muestra nanoHPLC (Agilent 1200 BrukerMicrOTOFQ) (Análisis de perfil) Análisis ESI-QQQ uPLC (Agilent 1260 Agilent 6410BA) Identificación y descripción de metabolitos Análisis GC/MS (Thermo GC8060 MD800 EI+) Análisis LC/MS/MS muestra nanoHPLC ESI-QqTof MS Cuantificación absoluta y relativa de pequeñas moléculas Análisis GC/MS SIM (Thermo GC8060 MD800 EI+, CI-, CI+) Análisis GC FID (Perkin Elmer) Perfil LC/MS ESI-QqTof de muestra nanoHPLC (Agilent 1200 BrukerMicrOTOFQ) (Análisis de perfil) Análisis UPLC ESI-QQQ, MRM (Agilent 1260 Agilent 6410BA) En esta sección, nuestra unidad ha desarrollado procedimientos para: ácidos grasos de cadena corta medianos y grandes en suero y membranas celulares aminoácidos ácidos orgánicos en orina acilcarnitinas plasmáticas prostanoides plasmáticos compuestos volátiles de carbono en el aliento hormonas tiroideas plasmáticas libres hormonas esteroideas en saliva azúcares en orina mucopolisacáridos en suero y orina

Categorización

Dominios RIS3CAT y otros

Dominios RIS3CAT
Categorías de CERCA GINYS

GINYS-IGTP-004

Procedimiento de acceso y tarifas

Abierto

Redes institucionales