Plataforma de genómica y transcriptómica

La plataforma de Genómica y Transcriptómica es un núcleo centrado en ofrecer asesoramiento, servicios específicos en técnicas genómicas o transcriptómicas y poner a disposición de investigadores y comunidad científica equipamiento específico.

Contacto principal

Contactos Institucionales / Responsable de Plataformas

JC

Javier CrespoDirector de gestión de infraestructuras
Institut de Recerca Sant Pau

Contactos temporales

Sandra Camino López -

Sandra Camino López

Javier Crespo | Supervisor Responsable |   jcrespo@santpau.cat  

Centros CERCA

Barcelona, Spain

1992

Institut de Recerca Sant Pau

Propietarios

Lista Centros CERCA

Equipos y Servicios

Equipamiento específico: Plataforma de matriz del sistema Affymetrix GS 3000 (actualización 7G). Sistema de PCR rápida en tiempo real 7900HT (bloques de 96 y 384 pocillos y TLDA) (AB-ThermoFisher Sci). Bioanalyzer 2100 (Agilent Tech). Nanodrop 2000 (ThermoFisher Sci). Qubit 3.0 (ThermoFisher Sci). Lector de microplacas Infinite M200 PRO (Tecan): espectrofotómetro, fluorímetro y luminómetro. Secuenciador de electroforesis capilar 3130xl Genetic Analyzer (ThermoFisher Sci). Sistema de secuenciación de nueva generación Ion GeneStudio S5 con sistema Ion Chef (ThermoFisher Sci).

En concreto, GT Platform ofrece los siguientes servicios: Cuantificación y control de calidad de muestras de ácidos nucleicos (Qubit 3.0, Nanodrop 2000 y Bioanalyzer 2100) Procesado de muestras para estudios de Microarrays (Expresión génica, perfiles de miRNA, Citogenética, GWAS) Proyectos de PCR en tiempo real (Expresión génica, detección de miRNA, discriminación alélica, CNV, cuantificación absoluta…) Secuenciación de nueva generación: secuenciación de exomas, secuenciación dirigida de ARN o ADN (tecnología Ampli-Seq), secuenciación de small RNA, secuenciación de novo, ChiP-Seq, secuenciación 16S, metagenómica… Secuenciación Sanger: secuenciación de ADN, análisis de mutaciones y polimorfismos, estudios de metilación del ADN, identificación de microorganismos… Análisis de fragmentos: autentificación de líneas celulares, número de copias (MLPA), LOH, estudios de genotipado, inestabilidad de microsatélites, estudios de expansión de repeticiones de ADN…. Análisis de datos ómicos Algunos de los equipos utilizados para llevar a cabo estas técnicas pueden ser accesibles para los investigadores tras una formación específica de usuario.

Categorización

Dominios RIS3CAT y otros

Dominios RIS3CAT
Categorías de CERCA GINYS

GINYS-IRSP-005

Procedimiento de acceso y tarifas

Abierto. Consulta las condiciones.

Calidad Institucional