Bioestadística / Bioinformàtica

La missió de la Unitat de Bioestadística/Bioinformàtica és dur a terme recerca col·laborativa i oferir recursos de consultoria i recerca quantitativa a tots els grups de recerca de l'IRB Barcelona. Ajudem els científics oferint serveis de consultoria tant a curt com a llarg termini en les següents àrees:

  • Disseny experimental: mida de la mostra, disseny de l'estudi, planificació de la metodologia estadística

  • Anàlisi de dades: bases de dades clíniques o biomèdiques, dades genòmiques

  • Ajuda amb la metodologia estadística en investigacions pròpies o d'altres persones

  • Programari: ajuda en l'ús de programari, desenvolupament de programari per satisfer les necessitats especials de l'anàlisi de dades o el disseny d'estudis

  • Es duu a terme una recerca metodològica i es desenvolupen recursos en totes les àrees esmentades.

Dades provisionals

Dra. Camille Stephan-Otto Attolini - amille.stephan@irbbarcelona.org

Dra. Camille Stephan-Otto Attolini - DIRECTORA DE LES INSTAL·LACIONS PRINCIPALS

Silvia Álvarez (Cap de Serveis i Instal·lacions Bàsiques) |   silvia.alvarez@irbbarcelona.org  | +34 93 40 20144

Centres CERCA

Propietaris

Llista Centres CERCA

Equipament i Serveis

Microarrays: control de qualitat, expressió diferencial, anàlisi d'enriquiment de GO i KEGG, GSEA GO i KEGG, descobriment de signatures RNASeq: control de qualitat, expressió diferencial, anàlisi d'enriquiment de GO i KEGG, descobriment de signatures, canvi d'isoformes, crida SNP ChipSeq: processament, control de qualitat, definició màxima + anotació + visualització, unió diferencial + anàlisi integrativa Seqüenciació de tot el genoma: processament, control de qualitat, crida SNP, crida d'alteració del número de còpies Seqüenciació de l'exoma complet: processament, control de qualitat, crida SNP, crida d'alteració del número de còpies Proteòmica: processament, control de qualitat, expressió diferencial, anàlisi d'enriquiment de GO i KEGG Mineria i anàlisi de bases de dades públiques: selecció, curació de dades clíniques, processament de dades d'expressió, associació d'expressió i dades clíniques, integració del nombre de còpies / genòmica Anàlisi TCGA: anàlisi exploratòria en tots els tipus de càncer: associació entre expressió i variables clíniques, anàlisi detallada amb variables clíniques i tècniques de curació: associació amb expressió, integració de dades: nombre de còpies, expressió, mutacions, etc. Microbioma: control de qualitat + estimació d'OTU + abundància diferencial, anàlisi filogenètica Predicció d'unió: predicció de Unió d'ARN/ADN per proteïnes/gens Seqüenciació cel·lular única: processament, control de qualitat, expressió diferencial, agrupament, trajectòries, anàlisi d'enriquiment de GO i KEGG Assessorament: Assessorament estadístic, Anàlisi de dades, Serveis personalitzats Disseny experimental

Categorització

Dominis RIS3CAT

Dominis RIS3CAT
CERCA GINYS Categories

GINYS-IRB-007

Procediment d'accés i tarifes

Papers

Xarxes institucionals