
UEB – Bioestadística
Contactes institucionals / Cap de plataformes
MR
Dades provisionals
Centres CERCA

Barcelona, Spain
2002
Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR)
Propietaris
VHIR
Equipament i Serveis
La UEB disposa del maquinari i programari adequats per dur a terme les seves tasques: Estacions de treball HP amb dos/quatre processadors (quad* core) i 8/16 GiB de RAM executant-se sobre GNU/Linux Servidor i clúster d'alta capacitat per a processos que requereixen càlcul intensiu Node principal amb 64 GiB de RAM Diversos nodes secundaris per a càlcul paral·lel Servidor web per fer accessibles els resultats dels estudis i les eines d'anàlisi desenvolupades per la UEB Eines estadístiques i bioinformàtiques: Programari estadístic: R, Stata, SAS, PASS Eines d'anàlisi de dades: programari lliure/de codi obert (Bioconductor, GenePattern, Qiime, DAVID…) o propietari (Ingenuity Pathways, CLC Genomics Workbench) Eines de desenvolupament: MySQL, PHP, Perl, Python, Java
Assessorament estadístic i metodològic en recerca clínica i dades d'alt rendiment Assessorament en el desenvolupament del protocol del projecte de recerca Estudi de disseny Càlcul de la mida de la mostra Definició de variables Protocols i formularis de recollida de dades Format i gestió de dades per a estudis de dades d'alt rendiment Anàlisi de dades d'estudis de recerca clínica Execució i anàlisi de dades Disseny de bases de dades Validació de procediments de mesura Disseny d'anàlisi estadística Anàlisi bàsica de dades descriptives univariants / bivariants Anàlisi de correlació i modelització estadística Anàlisi de dades d'alt rendiment Anàlisi de dades de microarrays Anàlisi de dades RTqPCR (targetes microfluídiques). Anàlisi de variants d'exomes Estudis metagenòmics / metabarcodificació Anàlisi de dades de RNA-seq Altres estudis NGS – Anàlisi de dades de metilació – Seqüenciació “de novo”. Anàlisi avançada de dades Anàlisi integrativa de dades òmiques Selecció i validació de biomarcadors Comunicació de resultats científics Generació de taules i gràfics Redacció de mètodes d'anàlisi Interpretació de resultats Revisió estadística de publicacions o presentacions Respondre als comentaris dels revisors Desenvolupament i manteniment d'aplicacions bioinformàtiques Bases de dades locals o en línia específiques Aplicacions i interfícies d'usuari a mida Instal·lació i manteniment d'aplicacions bioinformàtiques Reserva de recursos (programari i maquinari) per a l'anàlisi de “big data”. Activitats de formació general o específica Cursos sobre temes generals (estadística, bioinformàtica) o específics (base de dades d'anàlisi d'expressió gènica, anàlisi de supervivència) Participació en programes de formació formal en l'entorn del VHIR o del VH
Categorització
Dominis RIS3CAT
Sistema Social i Sanitari
Sistema Industrial
Sistema educatiu i de generació de coneixement
TECNOLOGIES DE LA INFORMACIÓ
Bioestadística
GINYS-VHIR-010
Procediment d'accés i tarifes
Procediment d'accés obert
Mitjà
Qualitat institucional
Xarxes institucionals