Plataforma de descubrimiento de fármacos

En la Plataforma de Cribado de Fármacos (DSP), ofrecemos soporte experto para proyectos de Biología Química y Descubrimiento de Fármacos. Nuestra plataforma acepta proyectos de toda la comunidad investigadora del IRB Barcelona, así como de proyectos externos, tanto académicos como industriales. Nuestro equipo de expertos proporciona soporte experimental personalizado para una amplia gama de dianas y tecnologías durante la fase de Descubrimiento de Candidatos, desde el Cribado de Alto Rendimiento (HTS) hasta la Optimización de Leads. El uso de equipos de última generación (enumerados a continuación), junto con un robusto software de análisis, le permite ejecutar sus proyectos siguiendo los estándares industriales de forma precisa, rápida y fiable.

Bloques de contenido

Cell Explorer - Revity

  • Envision plate reader from Perkin Elmer: compatible with Fluorescence, Ultraluminescence, Absorbance, HTRF and Alpha

  • Echo 650 from Beckman Labcyte: acoustic dispenser from nano-drops of 2.5 nl

  • 2 Multidrop dispensers from Thermo

  • Automated plate incubator (44 plates) temperature, CO2 and humidity control

  • Plate hotel (63 plates); Sealer and peeler

Echo 650 - Beckman Coulter

  • Echo 650 - Beckman Coulter

Multidrop Dispenser - Thermo

Multidrop Dispenser - Thermo

Hamilton Vantage Robotic Laboratory Workstation - Hamilton

  • Liquid handling system with 384 and 8 pipetting heads MagTip: works as a bulk dispenser from 200 nl to 10 ul and for cherry pickings

  • Dianthus pico NANOTEMPER: 384 plate reader for drug-target interaction (TRIC and Spectral Shift)

  • Q50: Automatic freezer under inert atmosphere (735 plates)

  • Plate hotel (180 plates); Sealer and peeler

Q50 automatic freezer - Hamilton

Q50 automatic freezer - Hamilton

Dianthus - Nanotemper

Dianthus - Nanotemper

Certus - Fritz Gyger

Certus - Fritz Gyger

Dragonfly - Sptlabtech

Dragonfly - Sptlabtech

Other equipment

At IRB Barcelona, we have set up a screening platform with state-of-the-art technology, which allows HTS and provides support for Hit to Lead and Lead Optimization projects in an efficient and automated way. Different assays/processes can be run in parallel in an integrated or stand-alone manner.

Other instruments: BIOTEK washer (96 and 384 plate washer), Xcelligence (Agilent)

Compound Library

  • About 146,506 cherry-picked compounds from the 1.5M ChemDiv library representing a diverse chemical space

  • Focus libraries from MedChem (2,400 FDA-approved; 1,822 Clinical compounds; 2,349 Kinase Inhibitors; 3,716 Natural products; 3,676 Immunology/Inflammation; 969 Human Endogenous Metabolites; 449 Protein-protein Interaction Inhibitors; 1,000 fragments, 4,000 RNAs; 4,000 covalent binders)

Contactos temporales

Israel Ramos | Coordinador |   israel.ramos@irbbarcelona.org  | 934 039 941

Israel Ramos - Coordinador

Silvia Álvarez (Jefa de Servicios e Instalaciones Core) |   silvia.alvarez@irbbarcelona.org  | +34 93 40 20144

Centros CERCA

Propietarios

Lista Centros CERCA

Equipos y Servicios

En el IRB Barcelona, hemos implementado una plataforma de cribado con tecnología de vanguardia que permite el análisis de alta precisión (HTS) y proporciona soporte para proyectos de conversión de hits a lead y optimización de lead de forma eficiente y automatizada. Se pueden ejecutar diferentes ensayos/procesos en paralelo, de forma integrada o independiente. La plataforma está equipada con: estación de trabajo Cell Explorer de Perkin Elmer: plataforma de brazo robótico con software actualizado y gran capacidad de almacenamiento para el procesamiento automatizado de placas de ensayo, lo que permite la integración con todos los robots utilizados por la plataforma; lector de placas Envision de Perkin Elmer: compatible con diversas tecnologías (fluorescencia, ultraluminiscencia, absorbancia, FRET, alfa y polarización de fluorescencia); y Echo 650 de Beckman Labcyte: dispensador acústico capaz de añadir nanogotas de 2,5 nl, medir el contenido de DMSO y evitar la contaminación cruzada (sistema sin punta); compatible con muestras viscosas como extractos naturales. Dispensador multigota de Thermo: dispensador a granel capaz de añadir volúmenes desde 1000 μl hasta tan solo 1 µl. Zephyr de Perkin Elmer: pipeta de 96 pocillos. Lavador BIOTEK: lavador de placas de 96 y 384 pocillos. Incubadora de placas automatizada para experimentos bioquímicos o celulares con control de temperatura, CO₂ y humedad. Biblioteca de compuestos: 50 000 compuestos de la biblioteca ChemDiv, representativos de más de 1 500 000 de compuestos. Además, la biblioteca contiene subconjuntos específicos como interacción proteína-proteína (PPI), SNC, cáncer, conjuntos diversos y conjuntos similares a plomo, entre otros. 2400 compuestos de la colección de fármacos aprobados por la FDA de MCE. En constante crecimiento con el objetivo de alcanzar más de 100 000 compuestos (incluyendo compuestos patentados y novedosos) para 2024.

Ofrecemos soporte integral para el descubrimiento de fármacos, adaptado a las necesidades de los investigadores, desde el diseño experimental hasta la validación en laboratorio, con la posibilidad de análisis quimioinformáticos y bioinformáticos. Evaluamos la viabilidad teórica en términos de la relevancia de los ensayos, el nivel de rendimiento y la viabilidad técnica. A continuación, desarrollamos los ensayos, cumpliendo con los estándares industriales. La instrumentación disponible en el DSP es compatible con bibliotecas de moléculas pequeñas, extractos biológicos, péptidos, anticuerpos y otras moléculas. Nuestros servicios incluyen: Diseño experimental y viabilidad: Evaluación del proyecto respecto a la relevancia de los ensayos biológicos, las tecnologías, la rentabilidad y las cascadas de cribado, no solo en términos de eficacia, sino también de DMPK (Metabolismo de Fármacos y Farmacocinética) y seguridad. Desarrollo de ensayos: Siguiendo los estándares industriales, garantizamos las mejores condiciones para sus ensayos en presencia y ausencia de compuestos estándar (cinética, titulaciones de componentes del ensayo, miniaturización del ensayo, preincubación de compuestos, etc.) y el efecto DMSO, la reproducibilidad, la estabilidad de la señal y del reactivo, y los factores Z', entre otros. HTS: Cribado del conjunto de compuestos/extractos (desde conjuntos pequeños hasta grandes de 200.000 compuestos o más). El proceso incluye un cribado piloto (entre 2.000 y 5.000 compuestos), el cribado de la biblioteca (desde conjuntos pequeños hasta más de 200.000 compuestos) y la confirmación y validación de coincidencias mediante ensayos ortogonales y de dosis-respuesta. Además, podemos realizar agrupamiento químico. Sinergismo: Evaluación del efecto de las interacciones entre los diferentes componentes. Optimización de coincidencias y de coincidencias: Prueba de varios compuestos en modo dosis-respuesta (más de 64 compuestos a 10 dosis, por duplicado, al día) y caracterización del mecanismo de acción (mecanismo de unión, tiempo de residencia, etc.), entre otros. Podemos trabajar con ensayos bioquímicos y celulares en formatos de 96 y 384 pocillos para estudiar una amplia gama de objetivos mediante la evaluación de diferentes resultados biológicos: Los proyectos que se llevan a cabo en el DSP pueden utilizar una amplia gama de tecnologías de lectura: Absorbancia Fluorescencia Polarización de fluorescencia Luminiscencia FRET Tecnología Alpha ELISA Imágenes de alto contenido Cribado: plataforma de cribado + colaboración con la Instalación de microscopía digital avanzada.

Categorización

Dominios RIS3CAT y otros

Dominios RIS3CAT
Categorías de CERCA GINYS

GINYS-IRB-008

Procedimiento de acceso y tarifas

Redes institucionales