UEB – Bioestadística

La Unidad de Estadística y Bioinformática (UEB) se creó en 2008 con el objetivo de promover el uso y desarrollo de recursos estadísticos y bioinformáticos modernos en la investigación realizada en su entorno. Actualmente, la Unidad de Estadística y Bioinformática integra la antigua Unidad de Apoyo a la Metodología de la Investigación Biomédica (USMIB) y, dentro del Área de Apoyo Científico y Técnico del Vall d'Hebron Instituto de Investigación, tiene la misión de ofrecer asesoramiento, servicios y formación para la investigación clínica y biomédica. Los principales objetivos de la UEB son:

  • Proporcionar apoyo estadístico, metodológico y bioinformático a la investigación clínica y biomédica, principalmente en nuestro centro pero también en el resto de la comunidad.

  • Contribuir a la formación en estadística y bioinformática para la investigación clínica y biomédica, mediante la realización de cursos propios y la participación en la formación reglada del área del VHIR.

  • Realizar actividades de innovación y desarrollo en el campo de la estadística y la bioinformática, especialmente en todo lo que pueda suponer una mejora en los procedimientos y servicios prestados por la Unidad.

Contactos Institucionales / Responsable de Plataformas

MR

Marta Rosal FontanaPreclinical Core Facilities Coordinator
Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR)

Contactos temporales

Alex Sánchez Pla |  alex.sanchez@vhir.org  | 934 894 000 ext2691 |  ORCID 

Alex Sánchez Pla |  alex.sanchez@vhir.org  | 934 894 000 ext2691 |  ORCID 

Albert Barberà Lluis (Director del Hub de Terapias Avanzadas y Plataformas Tecnológicas) |   albert.barbera@vhir.org  

Centros CERCA

Propietarios

Lista Centros CERCA

Equipos y Servicios

La UEB cuenta con el hardware y software adecuado para llevar a cabo sus tareas: Estaciones de trabajo HP con dos/cuatro procesadores (quad*core) y 8/16 GiB de RAM corriendo sobre GNU/Linux Servidor y cluster de alta capacidad para procesos que requieren computación intensiva Nodo principal con 64 GiB de RAM Varios nodos secundarios para computación paralela Servidor web para hacer accesibles los resultados de los estudios y herramientas de análisis desarrolladas por la UEB Herramientas estadísticas y bioinformáticas: Software estadístico: R, Stata, SAS, PASS Herramientas de análisis de datos: software libre/abierto (Bioconductor, GenePattern, Qiime, DAVID…) o propietario (Ingenuity Pathways, CLC Genomics Workbench) Herramientas de desarrollo: MySQL, PHP, Perl, Python, Java

Asesoramiento estadístico y metodológico en investigación clínica y datos de alto rendimiento Asesoramiento en el desarrollo del protocolo del proyecto de investigación Estudio de diseño Cálculo del tamaño muestral Definición de variables Protocolos y formularios de recogida de datos Formato y gestión de datos para estudios de datos de alto rendimiento Análisis de datos de estudios de investigación clínica Ejecución y análisis de datos Diseño de bases de datos Validación de procedimientos de medición Diseño de análisis estadístico Análisis básico de datos descriptivos univariados / bivariados Análisis de correlación y modelado estadístico Análisis de datos de alto rendimiento Análisis de datos de microarrays Análisis de datos RTqPCR (tarjetas microfluídicas). Análisis de variantes del exoma Estudios metagenómicos / metabarcodificación Análisis de datos RNA-seq Otros estudios NGS – Análisis de datos de metilación – Secuenciación “de novo”. Análisis avanzado de datos. Análisis integrativo de datos ómicos. Selección y validación de biomarcadores. Comunicación de resultados científicos. Generación de tablas y gráficos. Redacción de métodos de análisis. Interpretación de resultados. Revisión estadística de publicaciones o presentaciones. Respuesta a comentarios de revisores. Desarrollo y mantenimiento de aplicaciones bioinformáticas. Bases de datos locales o en línea específicas. Aplicaciones e interfaces de usuario a medida. Instalación y mantenimiento de aplicaciones bioinformáticas. Reserva de recursos (software y hardware) para análisis de big data. Actividades de formación general o específica. Cursos sobre temas generales (estadística, bioinformática) o específicos (base de datos de análisis de expresión génica, análisis de supervivencia). Participación en programas de formación formal en el entorno del VHIR o VH.

Categorización

Dominios RIS3CAT y otros

Dominios RIS3CAT
Categorías de CERCA GINYS

GINYS-VHIR-010

Procedimiento de acceso y tarifas

Abierto. Procedimiento de acceso

Redes institucionales