
UEB – Bioestadística
Contactos Institucionales / Responsable de Plataformas
MR
Contactos temporales
Centros CERCA

Barcelona, Spain
2002
Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR)
Propietarios
VHIR
Equipos y Servicios
La UEB cuenta con el hardware y software adecuado para llevar a cabo sus tareas: Estaciones de trabajo HP con dos/cuatro procesadores (quad*core) y 8/16 GiB de RAM corriendo sobre GNU/Linux Servidor y cluster de alta capacidad para procesos que requieren computación intensiva Nodo principal con 64 GiB de RAM Varios nodos secundarios para computación paralela Servidor web para hacer accesibles los resultados de los estudios y herramientas de análisis desarrolladas por la UEB Herramientas estadísticas y bioinformáticas: Software estadístico: R, Stata, SAS, PASS Herramientas de análisis de datos: software libre/abierto (Bioconductor, GenePattern, Qiime, DAVID…) o propietario (Ingenuity Pathways, CLC Genomics Workbench) Herramientas de desarrollo: MySQL, PHP, Perl, Python, Java
Asesoramiento estadístico y metodológico en investigación clínica y datos de alto rendimiento Asesoramiento en el desarrollo del protocolo del proyecto de investigación Estudio de diseño Cálculo del tamaño muestral Definición de variables Protocolos y formularios de recogida de datos Formato y gestión de datos para estudios de datos de alto rendimiento Análisis de datos de estudios de investigación clínica Ejecución y análisis de datos Diseño de bases de datos Validación de procedimientos de medición Diseño de análisis estadístico Análisis básico de datos descriptivos univariados / bivariados Análisis de correlación y modelado estadístico Análisis de datos de alto rendimiento Análisis de datos de microarrays Análisis de datos RTqPCR (tarjetas microfluídicas). Análisis de variantes del exoma Estudios metagenómicos / metabarcodificación Análisis de datos RNA-seq Otros estudios NGS – Análisis de datos de metilación – Secuenciación “de novo”. Análisis avanzado de datos. Análisis integrativo de datos ómicos. Selección y validación de biomarcadores. Comunicación de resultados científicos. Generación de tablas y gráficos. Redacción de métodos de análisis. Interpretación de resultados. Revisión estadística de publicaciones o presentaciones. Respuesta a comentarios de revisores. Desarrollo y mantenimiento de aplicaciones bioinformáticas. Bases de datos locales o en línea específicas. Aplicaciones e interfaces de usuario a medida. Instalación y mantenimiento de aplicaciones bioinformáticas. Reserva de recursos (software y hardware) para análisis de big data. Actividades de formación general o específica. Cursos sobre temas generales (estadística, bioinformática) o específicos (base de datos de análisis de expresión génica, análisis de supervivencia). Participación en programas de formación formal en el entorno del VHIR o VH.
Categorización
Dominios RIS3CAT y otros
Sistema Social y de Salud
Sistema industrial
Sistema de educación y generación de conocimiento
TECNOLOGÍAS DE LA INFORMACIÓN
Bioestadística
GINYS-VHIR-010
Procedimiento de acceso y tarifas
Abierto. Procedimiento de acceso
Medio
Calidad Institucional
Redes institucionales